根据《湖北省工程研究中心管理办法》文件精神，工程研究中心严格实行“开放、流动、联合、竞争”的运行与管理模式，主要是以下：

“运行独立、全面开放”的组织管理模式；

“淡化身份、以用为主”的人事管理制度；

“面向需求、多元参与”的人才培养机制；

“市场导向、项目牵引”的科研创新模式；

“优势互补、流动有序”的资源配置机制；

“绩效挂钩、多方共赢”的利益分配机制，

研究中心将根据研究方向设置基金和开放课题，广泛吸引国内外优秀科技人才，积极开展国际国内合作与学术交流，不断增强活力，提高研究水平。

研究中心的建设经费采取学院投资为主、校外筹措为辅的办法，多方面、多渠道地筹措资金。主要的筹措方式有以下几种：中央财政与地方财政专项、省级专项建设拨款、黄冈市重大建设专项、学校自筹、科技成果转化、与企业合作开发等。

研究中心本着互惠互利的原则，积极开展多种形式的产学研及国内外科技合作与交流。进行多方面的运行机制探索，推动研究中心整体水平提高，促进研究中心科技成果的转化，增强研究中心发展能力，形成自我发展的良性运行机制。鼓励国内外企业、政府、个人以不同形式向实验室捐赠仪器设备、设立访问学者基金和研究生奖学金等。

建立以学术带头人为中心的科技创新核心集体指导下团体创新机制。建立信息采集发布、市场联络和应用开发试验基地，促进与地区和周边省市高校科研单位和企业建立伙伴关系，达到强强联合、互相促进、优势互补的目的，并积极参与国际竞争和国际合作。